成立背景
1987年政府實施天空開放政策，民航公司紛紛成立，然相關之飛安配套措施未能與時並進，1991年業界有鑒於此，在交通主管機關及航發會支持下，參照世界飛安基金會模式，研商成立「財團法人中華民國台灣飛行安全基金會」。1993年完成法人登記，並召開第一屆董事會。1994年成為世界飛安基金會會員。

組織特點
本會為非營利性財團法人，成立以來結合國際飛安組織與國內相關單位共同為提升我國飛安工作品質與水準而努力。我國飛安工作在主管機關交通部、民航局監督、及航空業者與相關單位共同努力下，已有長足進步，然飛安永遠有改善空間，是一項永續之工作，本會仍將扮演積極推動之角色，繼續完成既定工作外，並加強與國內外飛安相關機構聯繫與合作，以提升我國國際形象，展現我國飛安績效。

2021年3月起，財團法人中華航空事業發展基金會法人代表林俊良先生擔任本會董事長，持續配合民航政策，藉協調、支援與輔助功能，促進整體飛安系統運作順暢。